Aufgrund des intensiven Abbaus wurden in den Solnhofener Steinbrüchen bedeutende Fossilien entdeckt, darunter das berühmtste Fossil der Erde, der Urvogel Archaeopteryx.

Das Museum Solnhofen beherbergt dauerhaft das sechste und neunte Exemplar des Archaeopteryx. Heute werden alle Oberjuraplattenkalke der Fränkischen Alb unter dem Namen „Fossillagerstätten von Solnhofen“ geführt. Sie entstanden vor etwa 150 Millionen Jahren in einer tropischen Insel- und Lagunenlandschaft. Diese trägt den Namen „Solnhofen-Archipel“, und erstreckt sich von Solnhofen und Langenaltheim im Westen bis ins Regensburger Stadtgebiet.

Heute sind über 800 jurazeitliche Tier- und Pflanzenarten aus den Plattenkalken bekannt. Dazu gehören neben den Urvögeln allen voran auch kleine Raubdinosaurier und Flugsaurier, sowie Meeres- und Landkrokodile.

Das Jura-Museum ist das zweitgrößte Naturkundemuseum Bayerns – und sicher das am schönsten gelegene: In den Räumen der Eichstätter Willibaldsburg hoch über dem Altmühltal bietet es wunderbare Aussichten auf die Region, die für ihre hervorragend erhaltenen Fossilien aus der Jurazeit weltberühmt ist. Der Schwerpunkt der Ausstellung liegt daher auf den Fossilien der Solnhofener Plattenkalke, die durch die intensive Steinbruchtätigkeit in der Region zutage gefördert worden sind.